133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0146 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 69 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  53.03 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  51.52 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  42.42 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  48 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.5 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.51 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  37.88 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  40.85 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 70 aa  47.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.26 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.81 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  40.32 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.56 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  30.65 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  30.65 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  30.65 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.65 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.43 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  38.89 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  42 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>