153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1339 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
66 aa  129  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  66.67 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 
68 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  54.55 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.48 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  43.75 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
68 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.06 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  44.12 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.67 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.82 
 
 
347 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  36.36 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.28 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  63.89 
 
 
78 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40 
 
 
327 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.06 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  25.76 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.53 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.81 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  24.24 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  34.85 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>