More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0743 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  100 
 
 		 330 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  62.3 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  62.62 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  62.62 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  62.94 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  61.66 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  61.66 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  61.3 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  61.3 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  59.7 
 
 		 465 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  60.38 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  60.38 
 
 		 316 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  60.06 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  59.81 
 
 		 318 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  60.06 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  61.41 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  53.85 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  54.87 
 
 		 333 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  49.52 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  49.36 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  61.78 
 
 		 233 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  61.78 
 
 		 233 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  38.41 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  41.85 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  36.62 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  41.54 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  38.84 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  35.87 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  36.09 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  38.96 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  38.34 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  51.85 
 
 		 81 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  51.85 
 
 		 81 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  24.75 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.51 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 420 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  32.48 
 
 		 431 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 424 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 		 406 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  37.5 
 
 		 363 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 743 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 421 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1118  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.68 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.357165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  33.66 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  30.33 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 438 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  31.25 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 439 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  34.34 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  33.61 
 
 		 399 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  37.08 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 393 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 445 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.75 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  39.33 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>