More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1510 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  100 
 
 
235 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  64.07 
 
 
231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  62.83 
 
 
233 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  58.33 
 
 
233 aa  291  7e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  60.92 
 
 
242 aa  290  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  62.28 
 
 
230 aa  287  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  61.5 
 
 
232 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  60.81 
 
 
231 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  63.72 
 
 
235 aa  285  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  60.71 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
231 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  61.16 
 
 
236 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.8 
 
 
234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  62.17 
 
 
232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  58.85 
 
 
233 aa  270  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  57.94 
 
 
234 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  56.65 
 
 
233 aa  269  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  56.65 
 
 
233 aa  268  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  58.04 
 
 
236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.22 
 
 
235 aa  268  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 
235 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 
236 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  61.24 
 
 
234 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  55.9 
 
 
234 aa  266  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  55.79 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  61.24 
 
 
234 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  61.24 
 
 
234 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 
238 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 
230 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 
230 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.74 
 
 
235 aa  265  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  55.79 
 
 
233 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  56.65 
 
 
236 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 
230 aa  263  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  55.79 
 
 
238 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 
230 aa  263  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.74 
 
 
238 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  57.96 
 
 
259 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  56.44 
 
 
238 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  59.73 
 
 
229 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 
233 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  55.9 
 
 
234 aa  262  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  55.66 
 
 
226 aa  261  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 
233 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 
233 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  53.74 
 
 
229 aa  260  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  59.29 
 
 
239 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  58.44 
 
 
238 aa  259  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  57.33 
 
 
238 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  57.59 
 
 
241 aa  260  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 
237 aa  258  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  55.07 
 
 
232 aa  258  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 
233 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  54.01 
 
 
242 aa  258  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 
230 aa  258  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  50.87 
 
 
232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 
235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 
229 aa  258  6e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 
229 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 
229 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 
234 aa  257  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 
237 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
232 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 
232 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 
232 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  56.22 
 
 
229 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 
233 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  54.22 
 
 
232 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
232 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
232 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
232 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
232 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  57.45 
 
 
235 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  52 
 
 
232 aa  255  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  57.45 
 
 
235 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  57.45 
 
 
235 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  55.36 
 
 
237 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 
227 aa  255  5e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 
232 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  59.21 
 
 
231 aa  255  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 
232 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 
233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  52.42 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  55.16 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0641  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284093  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  58.41 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  58.04 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>