More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1332 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 		 228 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  61.61 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  47.89 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  45.86 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  55.28 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  51.59 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  52.8 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  55.28 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  54.7 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  54.1 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.99 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  47.73 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 		 234 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  52.59 
 
 		 263 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  55.26 
 
 		 297 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  55.26 
 
 		 297 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  47.24 
 
 		 299 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  58.04 
 
 		 242 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  47.65 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  48.78 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  49.61 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  48 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  50.45 
 
 		 273 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  50.89 
 
 		 226 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  51.35 
 
 		 305 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  58.88 
 
 		 325 aa  117  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  55.14 
 
 		 368 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  48.78 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  47.97 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  51.24 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  47.24 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  53.51 
 
 		 328 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.21 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  51.33 
 
 		 329 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  51.56 
 
 		 272 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  45.31 
 
 		 249 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  58.72 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  47.97 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  49.6 
 
 		 233 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  58.72 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  45.86 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.15 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  52.63 
 
 		 362 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  47.97 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  48.12 
 
 		 285 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  45.86 
 
 		 296 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  45.19 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  44.37 
 
 		 362 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  53.1 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  55.66 
 
 		 318 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  49.24 
 
 		 293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  48.67 
 
 		 281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  53.57 
 
 		 304 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  47.01 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  50.41 
 
 		 260 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  44.51 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 		 251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  50.88 
 
 		 354 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  50.42 
 
 		 291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  39.75 
 
 		 326 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 		 258 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  48.48 
 
 		 296 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  48.48 
 
 		 296 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 370 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  51.75 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  43.65 
 
 		 327 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  52.83 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  49.19 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  49.14 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.14 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  51.75 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  53.21 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  50.88 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  49.14 
 
 		 280 aa  104  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  42.86 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  45.24 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  42.02 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  42.02 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  42.86 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  46.88 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  39.61 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  50.88 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>