101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0011 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  580  1e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  99.3 
 
 
284 aa  576  1e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  64.13 
 
 
280 aa  368  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  64.66 
 
 
278 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  64.02 
 
 
275 aa  362  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  60 
 
 
286 aa  346  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  60.75 
 
 
279 aa  345  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  60.15 
 
 
282 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  61.24 
 
 
276 aa  339  3e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  58.46 
 
 
279 aa  335  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  60.92 
 
 
268 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  56.47 
 
 
280 aa  332  3e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  57.71 
 
 
297 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  62.45 
 
 
292 aa  326  3e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  60.75 
 
 
269 aa  323  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  58.17 
 
 
274 aa  322  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  62.08 
 
 
283 aa  322  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  58.17 
 
 
274 aa  322  6e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  55.02 
 
 
278 aa  321  9e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  56.78 
 
 
277 aa  320  1e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  57.14 
 
 
281 aa  318  4e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  58.24 
 
 
274 aa  318  7e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  54.51 
 
 
276 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  60.42 
 
 
272 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  56.78 
 
 
283 aa  310  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  55.3 
 
 
277 aa  308  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  56.25 
 
 
276 aa  308  9e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  58.59 
 
 
296 aa  304  1e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  59.84 
 
 
265 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  54.95 
 
 
283 aa  295  7e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  53.64 
 
 
279 aa  290  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  53.33 
 
 
301 aa  267  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  41.47 
 
 
272 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  32.74 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  28.44 
 
 
296 aa  80.1  4e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  30.89 
 
 
339 aa  70.1  4e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  69.7  5e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  24.62 
 
 
258 aa  68.6  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.06769e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 
328 aa  66.6  5e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  30.34 
 
 
330 aa  65.5  1e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  40.2 
 
 
323 aa  63.2  5e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  27.47 
 
 
336 aa  62  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  35.54 
 
 
244 aa  58.2  1e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  58.2  1e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  37.97 
 
 
620 aa  57  4e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  22.63 
 
 
354 aa  55.5  1e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  25.91 
 
 
368 aa  53.1  5e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  25.91 
 
 
368 aa  53.1  5e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  22.58 
 
 
349 aa  52.8  6e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  35.23 
 
 
351 aa  50.4  3e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  42.19 
 
 
354 aa  50.1  4e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  39.05 
 
 
347 aa  49.7  5e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  38.24 
 
 
216 aa  49.7  6e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  39.06 
 
 
247 aa  49.7  6e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  25.56 
 
 
286 aa  48.9  9e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  47.37 
 
 
361 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  25.77 
 
 
1156 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  35.56 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.86 
 
 
326 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.60798e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  25.77 
 
 
651 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  28.25 
 
 
286 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  25.77 
 
 
651 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  29.32 
 
 
683 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  29.32 
 
 
684 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  29.32 
 
 
684 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  33.33 
 
 
290 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  41.67 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  40 
 
 
447 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  30.47 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  29.17 
 
 
564 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  34.29 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  32 
 
 
688 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.92191e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  34.29 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.83 
 
 
640 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  35.59 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  28.95 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  27.04 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  23.6 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.02689e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  34.29 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  27.34 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  35.59 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  30.08 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  26.11 
 
 
689 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  27.78 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  29.2 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 
633 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  34.85 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  31.25 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.68 
 
 
590 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  3.75913e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  39.56 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
828 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  36.62 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  33.9 
 
 
247 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  29.79 
 
 
652 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  31.96 
 
 
229 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  34.78 
 
 
388 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  37.88 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  31.96 
 
 
229 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  32.14 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>