More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0232 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  79.76 
 
 		 171 aa  274  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  82.56 
 
 		 172 aa  267  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  80.36 
 
 		 171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  80.36 
 
 		 171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  80.36 
 
 		 171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  80.36 
 
 		 171 aa  250  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  80.47 
 
 		 170 aa  246  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  52.33 
 
 		 172 aa  181  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 194 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  54.39 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  51.74 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  52.35 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  52.35 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  170  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  49.42 
 
 		 172 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  46.51 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  44.77 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  54.17 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.36 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  41.96 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  38.73 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  42 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  41.45 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  41.45 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.46 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.78 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  35.15 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  35.15 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  41.22 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  32.57 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  32.57 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  36.93 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>