More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0095 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  100 
 
 		 457 aa  923    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  63.51 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  62.18 
 
 		 437 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  64.75 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  64.75 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  56.31 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  55.29 
 
 		 444 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  43.05 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  41.27 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  40.4 
 
 		 454 aa  342  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  42.59 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  43.2 
 
 		 447 aa  332  8e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  39.72 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  40 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  42.82 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  40.39 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  39.76 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  40.05 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  38.2 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  41.91 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  39.95 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  37.27 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  37.32 
 
 		 462 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  41.91 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  39.72 
 
 		 427 aa  293  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  39.72 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  41.65 
 
 		 437 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  39.66 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  36.82 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  34.98 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  33.03 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  30.63 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  32.03 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  31.28 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.57 
 
 		 429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  33.79 
 
 		 461 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  29.45 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  33.17 
 
 		 495 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  33.17 
 
 		 495 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  30.16 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  32.6 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  32.44 
 
 		 451 aa  206  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  32.11 
 
 		 438 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  29.4 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  30.35 
 
 		 439 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.9 
 
 		 451 aa  203  5e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  33.18 
 
 		 460 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  31.98 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  30.49 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  31.64 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  28.31 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  31.23 
 
 		 496 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 		 496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  32.51 
 
 		 460 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  30.75 
 
 		 496 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  31.48 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  31.48 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  28.94 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  28.94 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  31.26 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  31.23 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  28.64 
 
 		 515 aa  190  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  32.73 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  30.31 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  29.83 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  28.54 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  28.54 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  28.4 
 
 		 528 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  32.24 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  30.7 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  27.21 
 
 		 482 aa  183  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  28.16 
 
 		 502 aa  183  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  30.86 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  32.78 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  29.95 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  29.95 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  29.31 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  30.58 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  28.85 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  27.74 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  32.35 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  27.9 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 		 896 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  27.55 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  30.99 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  28.08 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  30.51 
 
 		 471 aa  173  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  28.43 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  27.41 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  27.35 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.54 
 
 		 945 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 		 492 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  28.43 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 		 487 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  27.13 
 
 		 487 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  27.16 
 
 		 497 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  26.77 
 
 		 492 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>