71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2281 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  711    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  48.44 
 
 		 914 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  41.67 
 
 		 663 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  30.59 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 990 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 959 aa  50.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 964 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  37.14 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  44 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  41.82 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  57.5 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  57.5 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  42.55 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  44.93 
 
 		 901 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  32.35 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  39.29 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.17 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  45.24 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  45.24 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  22.28 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  29.13 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  45.24 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  44.68 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  45.24 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  50.91 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  38.78 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  42.55 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  37.5 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  45.24 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  45.24 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  45.24 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  40.91 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  36.49 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  29.33 
 
 		 651 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  47.06 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  34.29 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  36.73 
 
 		 659 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  42.55 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  34.04 
 
 		 566 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  34.67 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  42.22 
 
 		 235 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  38.3 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  48.65 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0392  Heat shock protein 70  25 
 
 		 610 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27278  normal  0.286405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>