282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0155 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0155  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  100 
 
 
623 aa  1258    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541883  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0154  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.3 
 
 
692 aa  180  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.152136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
1805 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 
1119 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  30.73 
 
 
358 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1545  histidine kinase  24.07 
 
 
708 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00108525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 
1133 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  24.29 
 
 
641 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 
1130 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 
482 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
364 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  29.31 
 
 
641 aa  97.8  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  23.96 
 
 
787 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.01 
 
 
737 aa  90.1  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
469 aa  87  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  27.15 
 
 
734 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  27.03 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2585  methyl-accepting chemotaxis domain/unknown domain-containing protein  25.07 
 
 
775 aa  84.7  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000884798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
740 aa  84  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 
741 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  26.07 
 
 
459 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.27 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  23.79 
 
 
760 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.2 
 
 
701 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  26.86 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.74 
 
 
660 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
860 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
658 aa  77  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
861 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  23.89 
 
 
729 aa  76.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.95 
 
 
764 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  26.22 
 
 
717 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 
746 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  28.63 
 
 
903 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.76 
 
 
753 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  24.08 
 
 
759 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.8 
 
 
638 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.97 
 
 
758 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  24.79 
 
 
758 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  22.52 
 
 
735 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  27.65 
 
 
651 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 
701 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  21.03 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  24.22 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25.51 
 
 
758 aa  70.5  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
858 aa  70.5  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  24.77 
 
 
636 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.11 
 
 
648 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.29 
 
 
758 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.22 
 
 
725 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
643 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  24.89 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.32 
 
 
797 aa  68.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 
859 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.03 
 
 
696 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1171  intracellular signalling protein  26.75 
 
 
690 aa  68.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.28 
 
 
723 aa  68.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.27 
 
 
757 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  24.84 
 
 
654 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  23.66 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.16 
 
 
656 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.19 
 
 
672 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  21.94 
 
 
756 aa  67.4  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  23.29 
 
 
645 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  25.53 
 
 
464 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  25.73 
 
 
699 aa  66.6  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 
864 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 
911 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.27 
 
 
703 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
752 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  23.64 
 
 
696 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  24.41 
 
 
701 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  23.94 
 
 
701 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  23.39 
 
 
593 aa  66.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  23.49 
 
 
667 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  28.39 
 
 
1018 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 
428 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  23.13 
 
 
637 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25 
 
 
465 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.78 
 
 
440 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  21.5 
 
 
670 aa  64.3  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  25.2 
 
 
641 aa  63.9  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  24.23 
 
 
561 aa  63.9  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  24.87 
 
 
517 aa  63.9  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
488 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.69 
 
 
1020 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  19.05 
 
 
723 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  23.12 
 
 
431 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 
1207 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.9 
 
 
585 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  27.55 
 
 
744 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 
738 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.66 
 
 
656 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  25.99 
 
 
437 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  26.52 
 
 
577 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.22 
 
 
657 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  29.87 
 
 
586 aa  62.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  29.56 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
523 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>