More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1894 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  100 
 
 		 359 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 377 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  50 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 377 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  50.13 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  37.22 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  63.58 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 307 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 504 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 449 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  31.71 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.17 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.66 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3204  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  52.78 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  30 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.11 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.39 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  29.8 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.66 
 
 		 463 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 463 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.11 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  26.18 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 463 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.95 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.95 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.95 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 463 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.86 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  28.85 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.94 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.94 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.94 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.94 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.14 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  26.71 
 
 		 679 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  30 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  29.24 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.24 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.62 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 484 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  25.32 
 
 		 663 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  25.47 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  27.35 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.24 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.24 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>