More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1314 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.68 
 
 
646 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.68 
 
 
646 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.16 
 
 
667 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  73.31 
 
 
624 aa  894    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  62.73 
 
 
645 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  73.27 
 
 
619 aa  884    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  73.11 
 
 
620 aa  872    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.52 
 
 
673 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  73.91 
 
 
629 aa  895    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.04 
 
 
625 aa  912    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  73.55 
 
 
624 aa  859    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.66 
 
 
645 aa  696    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.27 
 
 
623 aa  839    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  73.43 
 
 
620 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  100 
 
 
623 aa  1240    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  73.43 
 
 
625 aa  883    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  73.11 
 
 
620 aa  890    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.52 
 
 
673 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  72.95 
 
 
620 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  66.94 
 
 
621 aa  795    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  73.63 
 
 
635 aa  877    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.41 
 
 
607 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  55.13 
 
 
702 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 
705 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.2 
 
 
706 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.25 
 
 
687 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 
647 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 
630 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.19 
 
 
623 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 
618 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 
602 aa  585  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.37 
 
 
618 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  54.02 
 
 
621 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.39 
 
 
610 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.08 
 
 
610 aa  580  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 
717 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 
714 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  55.96 
 
 
646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 
696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
610 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 
713 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  53.36 
 
 
617 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  50 
 
 
663 aa  569  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  51.39 
 
 
617 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.27 
 
 
663 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  51.39 
 
 
617 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.27 
 
 
663 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  52.64 
 
 
630 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  52.81 
 
 
643 aa  570  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  51.4 
 
 
616 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.35 
 
 
676 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1259  cell division protein FtsH  48.94 
 
 
645 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  51.8 
 
 
618 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.56 
 
 
655 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1134  cell division protein FtsH  48.94 
 
 
645 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
610 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.72 
 
 
655 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.75 
 
 
658 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.83 
 
 
617 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.94 
 
 
618 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.37 
 
 
639 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 
616 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  54.72 
 
 
692 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  53.31 
 
 
605 aa  558  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.02 
 
 
645 aa  561  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  51.29 
 
 
648 aa  561  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 
605 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.8 
 
 
617 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.9 
 
 
613 aa  558  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  52.5 
 
 
602 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
686 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49 
 
 
697 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  50.89 
 
 
619 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
608 aa  555  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1261  cell division protein FtsH  49.26 
 
 
640 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.112484  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.74 
 
 
616 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.17 
 
 
624 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.74 
 
 
616 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.77 
 
 
615 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  52.82 
 
 
613 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0605  cell division protein FtsH  50.87 
 
 
645 aa  558  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  48.53 
 
 
641 aa  553  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.51 
 
 
643 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  52.94 
 
 
627 aa  555  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  51.07 
 
 
613 aa  554  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  51.83 
 
 
637 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 
635 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  52.16 
 
 
613 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  51.73 
 
 
615 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.32 
 
 
616 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  53.46 
 
 
635 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 
616 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 
658 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 
676 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 
658 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
635 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 
699 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>