More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0969 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
275 aa  564  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  75 
 
 
278 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  70.33 
 
 
280 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  62.82 
 
 
291 aa  361  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  62.82 
 
 
291 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  62.82 
 
 
291 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  61.09 
 
 
291 aa  348  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  61.68 
 
 
291 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  60.93 
 
 
295 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  61.89 
 
 
300 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  57.71 
 
 
291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  58.12 
 
 
290 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  55.07 
 
 
290 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  59.62 
 
 
278 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  54.71 
 
 
290 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  55.43 
 
 
290 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  60.45 
 
 
302 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  54.35 
 
 
294 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  56.27 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  57.03 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  56.32 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  57.69 
 
 
275 aa  311  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  54.15 
 
 
291 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  54.72 
 
 
291 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  54.72 
 
 
291 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  54.72 
 
 
291 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  53.79 
 
 
339 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  54.72 
 
 
291 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  53.79 
 
 
339 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  57.03 
 
 
275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  53.79 
 
 
291 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  53.79 
 
 
291 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  53.79 
 
 
291 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  54.87 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  56 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  54.15 
 
 
291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  54.15 
 
 
291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  54.15 
 
 
291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  54.15 
 
 
291 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  54.32 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  54.71 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  54.35 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  54.35 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
271 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  54.55 
 
 
269 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  53.99 
 
 
271 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  55.56 
 
 
291 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  50.73 
 
 
277 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  54.37 
 
 
271 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  54.17 
 
 
269 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  54.17 
 
 
267 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  54.37 
 
 
271 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  54.37 
 
 
271 aa  299  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  55 
 
 
275 aa  297  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  54.06 
 
 
291 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  54.9 
 
 
256 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  53.23 
 
 
270 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
299 aa  292  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  52.71 
 
 
291 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  54.18 
 
 
298 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  51.42 
 
 
292 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  51.5 
 
 
270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  51.42 
 
 
292 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  51.94 
 
 
307 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  56.63 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  56.63 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  51.09 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  47.25 
 
 
287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  35.63 
 
 
251 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  35 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  35.24 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  36.82 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.88 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  31.97 
 
 
324 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 
248 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 
245 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 
313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  32.14 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 
244 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  34.44 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.64 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  36.6 
 
 
223 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 
214 aa  106  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 
229 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  31.01 
 
 
296 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
250 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  29.12 
 
 
295 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 
291 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 
295 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 
229 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
229 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
229 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
246 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>