More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1355 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  40.58 
 
 		 1150 aa  771    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  47.18 
 
 		 1173 aa  1032    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  64.68 
 
 		 1183 aa  1607    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  44.62 
 
 		 1214 aa  951    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39 
 
 		 1132 aa  767    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  66.58 
 
 		 1212 aa  1649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  48.29 
 
 		 1171 aa  1045    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39 
 
 		 1132 aa  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.01 
 
 		 1133 aa  763    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39 
 
 		 1133 aa  766    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  47.36 
 
 		 1151 aa  978    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  48.27 
 
 		 1178 aa  1058    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  46.92 
 
 		 1176 aa  1030    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  48.61 
 
 		 1158 aa  1060    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  62.14 
 
 		 1182 aa  1547    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  40.67 
 
 		 1150 aa  771    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  41.46 
 
 		 1149 aa  768    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.24 
 
 		 1156 aa  873    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  42.03 
 
 		 1136 aa  819    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  66.33 
 
 		 1178 aa  1616    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  59.28 
 
 		 1187 aa  1520    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  61.88 
 
 		 1191 aa  1560    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39 
 
 		 1132 aa  766    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.91 
 
 		 1132 aa  765    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  48.11 
 
 		 1168 aa  1029    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  64.27 
 
 		 1191 aa  1622    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  85.69 
 
 		 1208 aa  2158    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 1208 aa  2489    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  48.93 
 
 		 1184 aa  1071    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  40.78 
 
 		 1169 aa  823    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  47.51 
 
 		 1215 aa  1041    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39 
 
 		 1132 aa  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  41.04 
 
 		 1163 aa  851    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  60.67 
 
 		 1188 aa  1547    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  72.2 
 
 		 1190 aa  1744    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  48.49 
 
 		 1169 aa  1058    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  48.6 
 
 		 1182 aa  1045    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  61.12 
 
 		 1188 aa  1534    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  62.4 
 
 		 1182 aa  1550    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  40.8 
 
 		 1150 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  38.93 
 
 		 1180 aa  799    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.26 
 
 		 1132 aa  783    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.9 
 
 		 1132 aa  764    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  39.03 
 
 		 1132 aa  763    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  46.47 
 
 		 1193 aa  988    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  46.5 
 
 		 1171 aa  994    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  47.35 
 
 		 1192 aa  1061    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  49.03 
 
 		 1154 aa  1078    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  38.58 
 
 		 1189 aa  774    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  48.78 
 
 		 1154 aa  1095    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  65.55 
 
 		 1197 aa  1617    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  63.55 
 
 		 1224 aa  1577    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  38.69 
 
 		 1132 aa  757    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  48.29 
 
 		 1167 aa  1044    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  39.47 
 
 		 1208 aa  800    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  60.67 
 
 		 1188 aa  1540    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  46.47 
 
 		 1181 aa  1006    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  45.36 
 
 		 1216 aa  952    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.98 
 
 		 1136 aa  780    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  66.22 
 
 		 1176 aa  1640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  40.24 
 
 		 1196 aa  818    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  64.6 
 
 		 1191 aa  1631    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  48.66 
 
 		 1158 aa  1039    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  46.68 
 
 		 1199 aa  1004    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  49.03 
 
 		 1157 aa  1075    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  48.17 
 
 		 1195 aa  1022    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  46.26 
 
 		 1156 aa  1019    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  73.36 
 
 		 1214 aa  1837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  45.82 
 
 		 1223 aa  1030    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  39 
 
 		 1254 aa  790    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  33.6 
 
 		 1266 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  32.22 
 
 		 1261 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  32.73 
 
 		 1274 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  32.84 
 
 		 1232 aa  594  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  33.86 
 
 		 1232 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  33.17 
 
 		 1250 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  33.66 
 
 		 1257 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  34.09 
 
 		 1226 aa  588  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  33.39 
 
 		 1245 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  33.68 
 
 		 1264 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  33.68 
 
 		 1236 aa  586  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  32.83 
 
 		 1262 aa  582  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1257 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  31.77 
 
 		 1263 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  33.09 
 
 		 1241 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  32.9 
 
 		 1243 aa  574  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  32.96 
 
 		 1250 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  32.99 
 
 		 1245 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  33.52 
 
 		 1224 aa  571  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  32.71 
 
 		 1257 aa  572  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  33.28 
 
 		 1271 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  32.82 
 
 		 1232 aa  572  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  32.82 
 
 		 1237 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  30.86 
 
 		 1230 aa  568  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.92 
 
 		 1226 aa  568  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  32.93 
 
 		 1227 aa  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  31.73 
 
 		 1209 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  33.06 
 
 		 1228 aa  569  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1228 aa  567  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  32.57 
 
 		 1227 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>