More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1219 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1250  ATPase  84.38 
 
 
237 aa  358  4e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  79.28 
 
 
229 aa  348  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  74.09 
 
 
230 aa  343  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  74.09 
 
 
230 aa  343  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  73.52 
 
 
251 aa  335  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  69.78 
 
 
237 aa  334  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  68.3 
 
 
242 aa  327  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  67.86 
 
 
242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  67.86 
 
 
242 aa  324  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  61.82 
 
 
237 aa  278  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  53.85 
 
 
225 aa  261  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  55.66 
 
 
237 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  55.66 
 
 
237 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  56.82 
 
 
241 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 
231 aa  251  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  54.55 
 
 
244 aa  248  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  53.64 
 
 
232 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  51.36 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  53.15 
 
 
453 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  51.35 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  52.75 
 
 
237 aa  238  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  52.29 
 
 
242 aa  237  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  51.34 
 
 
231 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0599  ABC transporter-like  51.27 
 
 
246 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  48.42 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.49 
 
 
408 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  48.84 
 
 
217 aa  198  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  46.88 
 
 
255 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  46.88 
 
 
252 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  45.66 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  47.25 
 
 
245 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  39.82 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 
259 aa  181  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  39.38 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  45.91 
 
 
233 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  45.09 
 
 
230 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  41.7 
 
 
240 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  40.89 
 
 
244 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  40.54 
 
 
241 aa  174  9e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.95 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  46.89 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  39.37 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  41.89 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  45.09 
 
 
240 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  41.7 
 
 
224 aa  171  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40.54 
 
 
241 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  40.36 
 
 
241 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.78 
 
 
240 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 
345 aa  170  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  39.07 
 
 
225 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  40.89 
 
 
233 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  42.22 
 
 
228 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.72 
 
 
228 aa  168  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  40.54 
 
 
249 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  42.99 
 
 
234 aa  168  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  38.74 
 
 
224 aa  168  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.15 
 
 
277 aa  167  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  38.12 
 
 
236 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  43.17 
 
 
235 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  39.64 
 
 
224 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf119  ABC transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  43.69 
 
 
230 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
233 aa  165  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.92 
 
 
604 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  42.53 
 
 
256 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  38.29 
 
 
234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 
228 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  37.84 
 
 
249 aa  164  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 
239 aa  164  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  38.74 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.19 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.11 
 
 
234 aa  162  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
234 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  39.35 
 
 
238 aa  162  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
229 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.11 
 
 
234 aa  162  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.17 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.67 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44.09 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  38.29 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 
223 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
223 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
223 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 
223 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  34.98 
 
 
233 aa  161  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  44.06 
 
 
235 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
237 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
233 aa  161  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  46.26 
 
 
230 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  38.29 
 
 
225 aa  161  9e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  41.07 
 
 
237 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>