More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3854 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 574 aa  1193    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  45.8 
 
 		 577 aa  458  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  38.36 
 
 		 563 aa  323  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  38 
 
 		 614 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 		 864 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.33 
 
 		 896 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.82 
 
 		 864 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.82 
 
 		 864 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.93 
 
 		 896 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.23 
 
 		 896 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.58 
 
 		 891 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  37.37 
 
 		 894 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.22 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  34.63 
 
 		 479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  25.97 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  33.82 
 
 		 462 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.34 
 
 		 464 aa  113  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  35.35 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  34.36 
 
 		 448 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  32.66 
 
 		 448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.85 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.3 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.29 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  25.42 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.74 
 
 		 461 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  32.84 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  30.94 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  31.38 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  34.87 
 
 		 461 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  32.66 
 
 		 448 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.48 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.86 
 
 		 465 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.68 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.93 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  31.16 
 
 		 474 aa  98.6  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  32.16 
 
 		 473 aa  98.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  33.16 
 
 		 458 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  35.16 
 
 		 471 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 		 481 aa  97.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  34.2 
 
 		 532 aa  97.1  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  32.02 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.17 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 		 468 aa  94  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  33.88 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  29 
 
 		 705 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.95 
 
 		 444 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 446 aa  90.9  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  28.91 
 
 		 454 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.43 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.94 
 
 		 444 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  32.83 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.46 
 
 		 466 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.65 
 
 		 456 aa  87.8  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.99 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  28.85 
 
 		 752 aa  84.7  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.98 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  35.16 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  29.27 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.21 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  26.28 
 
 		 462 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  35.2 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.84 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  29.11 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  30.05 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.73 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.03 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  23.85 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.37 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.78 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 		 982 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.85 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.93 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  30.19 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  34.02 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.39 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  31.64 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  29.96 
 
 		 446 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 490 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05417  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00430)  28.57 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  32.82 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 		 726 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  27.39 
 
 		 470 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  29.63 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>