More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0495 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  55.75 
 
 		 689 aa  717    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  54.36 
 
 		 636 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 662 aa  1349    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  46.45 
 
 		 648 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  46.28 
 
 		 648 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  46.45 
 
 		 648 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  45.92 
 
 		 647 aa  508  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  45.08 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  46.25 
 
 		 681 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  46.6 
 
 		 649 aa  501  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  45.01 
 
 		 628 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  44.68 
 
 		 624 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  44.06 
 
 		 647 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  43.76 
 
 		 670 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  43.45 
 
 		 658 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  40.48 
 
 		 634 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  41.06 
 
 		 634 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  40.86 
 
 		 639 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 		 643 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.69 
 
 		 639 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  38.6 
 
 		 611 aa  369  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  38.02 
 
 		 609 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 		 642 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.66 
 
 		 645 aa  362  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  37.33 
 
 		 619 aa  361  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 		 630 aa  360  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 		 636 aa  359  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.49 
 
 		 647 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 619 aa  353  5.9999999999999994e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.44 
 
 		 636 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  36.97 
 
 		 630 aa  349  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.39 
 
 		 640 aa  349  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  34.65 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  34.65 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  34.82 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 		 618 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  34.65 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  34.65 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  35.05 
 
 		 634 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 645 aa  343  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  37.01 
 
 		 627 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 		 631 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.05 
 
 		 626 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 		 630 aa  333  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  34.45 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 		 607 aa  332  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  33.54 
 
 		 638 aa  330  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  34.97 
 
 		 640 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 634 aa  330  7e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 		 632 aa  329  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.59 
 
 		 646 aa  329  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 		 631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  36.43 
 
 		 600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  36.71 
 
 		 631 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 633 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 633 aa  328  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  36.42 
 
 		 629 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  35.14 
 
 		 602 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.63 
 
 		 629 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  35.14 
 
 		 602 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  33.61 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  33.61 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.54 
 
 		 641 aa  327  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  36.42 
 
 		 629 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 634 aa  327  6e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  37.65 
 
 		 646 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 		 634 aa  326  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 		 640 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 633 aa  326  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 		 637 aa  325  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 643 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.93 
 
 		 631 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  33.17 
 
 		 615 aa  324  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 612 aa  324  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  33.44 
 
 		 637 aa  323  6e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 597 aa  323  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 646 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.52 
 
 		 629 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  33.85 
 
 		 608 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 636 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 631 aa  321  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.94 
 
 		 801 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  32.02 
 
 		 755 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 631 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 631 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.63 
 
 		 628 aa  320  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 		 641 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  34.08 
 
 		 607 aa  319  1e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>