More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0497 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  52.69 
 
 
639 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
634 aa  1273    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  43.89 
 
 
634 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  39.5 
 
 
647 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  39.58 
 
 
648 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  41.11 
 
 
649 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  39.74 
 
 
648 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  39.74 
 
 
648 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  40.9 
 
 
681 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  41.06 
 
 
662 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 
647 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  39.21 
 
 
628 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  38.13 
 
 
648 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 
624 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 
689 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  39.26 
 
 
658 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  38.95 
 
 
670 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  38.53 
 
 
636 aa  365  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 
643 aa  331  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 
618 aa  330  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  37.97 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  36.18 
 
 
602 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  36.18 
 
 
602 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.13 
 
 
639 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  38.63 
 
 
619 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 
634 aa  320  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  36.01 
 
 
611 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.2 
 
 
645 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
630 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 
640 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.74 
 
 
647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.19 
 
 
646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.76 
 
 
628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
645 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  35.58 
 
 
631 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  35.75 
 
 
655 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 
609 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 
629 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 
632 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 
667 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 
629 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  35.43 
 
 
646 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 
642 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 
636 aa  310  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  35.67 
 
 
646 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 
631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  35.25 
 
 
631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 
629 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.33 
 
 
627 aa  306  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  34.52 
 
 
629 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 
631 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 
630 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
619 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  35.46 
 
 
630 aa  300  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
629 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 
627 aa  297  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
610 aa  298  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
640 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.33 
 
 
803 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
802 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 
630 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
803 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  33.33 
 
 
809 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
802 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
802 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  33.57 
 
 
612 aa  293  6e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
802 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
802 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  30.92 
 
 
524 aa  292  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  33 
 
 
631 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  33.39 
 
 
615 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 
631 aa  291  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  32.14 
 
 
610 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 
641 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  33 
 
 
631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
618 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
618 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  32.68 
 
 
775 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
761 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
765 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
765 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  33 
 
 
760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 
764 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 
631 aa  287  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  32.84 
 
 
756 aa  287  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.11 
 
 
641 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  32.05 
 
 
638 aa  286  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  31.09 
 
 
618 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  31.69 
 
 
632 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
646 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>