More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1763 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  79.1 
 
 
670 aa  997    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
658 aa  1337    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  46.05 
 
 
628 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  46.05 
 
 
624 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  43.87 
 
 
647 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  43.63 
 
 
648 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  41.63 
 
 
647 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  43.22 
 
 
648 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  41.64 
 
 
681 aa  458  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  45.06 
 
 
636 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  43.45 
 
 
662 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  43.21 
 
 
689 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  42.83 
 
 
648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  42.83 
 
 
648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  41.29 
 
 
634 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
649 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 
634 aa  392  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  37.86 
 
 
639 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 
643 aa  359  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  38.24 
 
 
611 aa  351  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.85 
 
 
647 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
609 aa  347  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.05 
 
 
640 aa  346  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.16 
 
 
645 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  37.63 
 
 
630 aa  346  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  33.7 
 
 
634 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  36.38 
 
 
619 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 
673 aa  345  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 
646 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  36.08 
 
 
801 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  35.21 
 
 
766 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
703 aa  343  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 
793 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 
631 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 
619 aa  340  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 
633 aa  339  9e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 
633 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  34.28 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  34.28 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  34.28 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 
636 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 
627 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 
636 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.49 
 
 
639 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  36.13 
 
 
802 aa  336  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
618 aa  335  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  34.72 
 
 
633 aa  334  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 
618 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
627 aa  333  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 
646 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  34.79 
 
 
629 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
618 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
618 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
610 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  34.79 
 
 
629 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  36.08 
 
 
803 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  36.08 
 
 
809 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 
650 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 
618 aa  331  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
618 aa  331  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 
642 aa  331  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  34.93 
 
 
801 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  34.9 
 
 
679 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  33.7 
 
 
631 aa  329  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  34.97 
 
 
775 aa  329  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 
631 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.87 
 
 
640 aa  329  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  34.93 
 
 
801 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  35.42 
 
 
631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 
630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  34.96 
 
 
771 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 
761 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  35.92 
 
 
803 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  33.7 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  34.47 
 
 
629 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
618 aa  326  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  33.01 
 
 
628 aa  326  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  34.7 
 
 
756 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  34.7 
 
 
760 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  34.65 
 
 
767 aa  326  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  36.39 
 
 
686 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
765 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
765 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  34.3 
 
 
629 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 
631 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
764 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 
618 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 
618 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 
632 aa  324  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  35.92 
 
 
802 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>