101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0343 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  62.39 
 
 		 123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  57.63 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  55.75 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  55.65 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  54.7 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  53.91 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  52.17 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  44.54 
 
 		 127 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  44.54 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  47.9 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  44.54 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  49.57 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  48.25 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.67 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  38.68 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  38.38 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.26 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  35.4 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  43 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  32.77 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.76 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.35 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  40.22 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  35.11 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.91 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.63 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  29.73 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  31.11 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.34 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  41.56 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.23 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  38.14 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  27.83 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29.87 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.86 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  32.79 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  29.13 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  28.81 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  31.37 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  35.14 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  36.96 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  34.69 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  26.04 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  34.75 
 
 		 319 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  33.66 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.52 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.52 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.29 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  29.59 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  38.37 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  34.69 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  28.16 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  28.89 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  25 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.42 
 
 		 178 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  37.35 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  30.84 
 
 		 330 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  31.37 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  30.19 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  30.19 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.42 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  30.19 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  31.13 
 
 		 332 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  25.96 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3323  protein of unknown function DUF35  51.02 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00494403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  24.53 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  24.53 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  24.53 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  24.53 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  24.53 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  24.53 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  27.83 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  23.96 
 
 		 137 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  24.14 
 
 		 141 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  25.47 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  29.07 
 
 		 144 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  29.82 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  29.52 
 
 		 334 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>