139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  100 
 
 		 397 aa  777    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  55.82 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  44.05 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  47.38 
 
 		 401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1675  protein of unknown function DUF405  50 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  44.39 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  46.15 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  34.77 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24980  predicted membrane protein  35.48 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14550  predicted membrane protein  35.04 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  34.64 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  30.07 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.26 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  29.6 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  30.47 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.3 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  29.24 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  28.53 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  30.12 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  28.01 
 
 		 430 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  27.7 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  27.52 
 
 		 430 aa  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.38 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  28.9 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  26.77 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  28.3 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  25.83 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  26.8 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  28.33 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  29.59 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  20.15 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  28.15 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  27.63 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  29.51 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  27.38 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  23.24 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  20.63 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  28.86 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  26.88 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  24.76 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  26.37 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  28.22 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  27.1 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  26.63 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  26.94 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  24.94 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  25.65 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  24.61 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  25.84 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  26.94 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  25.58 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  25.58 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  23.68 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  26.57 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  26.26 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  24.69 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  26.01 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  26.26 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  26.26 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  25.99 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  26.75 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  25.45 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  25.99 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  25.69 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  25.45 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  25.68 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  26.05 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  26.05 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  26.05 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  26.05 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  25.71 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  26.98 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  27.3 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  27.39 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  25.99 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  26.07 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  26.38 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  24.94 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  28.54 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  25.99 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  23.89 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  34.81 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  25.58 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  26.59 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  27.51 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  22.25 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  24.29 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  25.06 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  23.47 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  28.61 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  25.13 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  25.31 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  26.51 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  26.43 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  26.21 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  27.27 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  22.76 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  21.99 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>