More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2045 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  727    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  68.45 
 
 		 355 aa  511  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  66.48 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  67.89 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  66 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  67.61 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  67.61 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  68.45 
 
 		 355 aa  481  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  66.2 
 
 		 355 aa  481  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  67.04 
 
 		 355 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 355 aa  401  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  58.63 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  58.33 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.82 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.01 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 356 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  53.89 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  55.01 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  55.01 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.12 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 350 aa  381  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  55.13 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  53.01 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  53.47 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  52.72 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  58.18 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  52.89 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 363 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 363 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  52.15 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  52.6 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>