More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3682 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3682  patatin  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  93.84 
 
 		 276 aa  484  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  58.46 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  53.31 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  54.58 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  53.67 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  53.51 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  38.7 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  37.83 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  34.57 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  33.21 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  35.29 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  36.59 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  34.27 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  33.87 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  30.64 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  35.71 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  36.13 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  33.19 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  34.93 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  30.82 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  27.44 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27.8 
 
 		 760 aa  95.5  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.06 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  31.88 
 
 		 357 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.22 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.11 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  33.15 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.67 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.83 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.17 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.61 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  33.33 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.39 
 
 		 387 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  29.3 
 
 		 735 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  30.68 
 
 		 771 aa  86.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.41 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.63 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  28.97 
 
 		 751 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29.91 
 
 		 738 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  31.89 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  29.91 
 
 		 754 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  28.97 
 
 		 738 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  29.44 
 
 		 736 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  28.97 
 
 		 737 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  28.97 
 
 		 738 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  31.55 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  27.78 
 
 		 735 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.31 
 
 		 739 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  33.5 
 
 		 368 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  28.07 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  27.8 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  34.27 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  33.19 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.84 
 
 		 738 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  27.8 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  27.8 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  29.34 
 
 		 933 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  29.34 
 
 		 945 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  29.34 
 
 		 728 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 920 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  28.51 
 
 		 798 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  34.1 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  27.8 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  34.15 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  29.34 
 
 		 930 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.84 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  27.8 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  28.5 
 
 		 738 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  30.62 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.84 
 
 		 738 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  27.32 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  28.97 
 
 		 738 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.88 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  27.32 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  29.5 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  30.54 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  27.32 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  30.37 
 
 		 734 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.58 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  28.93 
 
 		 852 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  28.51 
 
 		 796 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.42 
 
 		 748 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.86 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.27 
 
 		 740 aa  79  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  29.07 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  31.15 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  31.98 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  28.11 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  27.32 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  31.89 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  27.32 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  32.8 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  29.24 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  32.29 
 
 		 583 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  27.88 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  27.92 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  28.12 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  28.12 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  28.12 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>