145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1620 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 882 aa  1787    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  47.12 
 
 		 835 aa  716    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  47.2 
 
 		 854 aa  744    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  46.73 
 
 		 854 aa  748    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  46.61 
 
 		 853 aa  738    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  47.46 
 
 		 853 aa  743    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  66.02 
 
 		 877 aa  1182    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  49.1 
 
 		 871 aa  782    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  39.32 
 
 		 852 aa  598  1e-169  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  27.88 
 
 		 785 aa  211  6e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  28.32 
 
 		 780 aa  207  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  27.28 
 
 		 784 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  28.15 
 
 		 783 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  28.01 
 
 		 780 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  29.01 
 
 		 781 aa  202  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  27.74 
 
 		 786 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  28.4 
 
 		 781 aa  195  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  26.35 
 
 		 783 aa  185  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  27.26 
 
 		 810 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  25.28 
 
 		 818 aa  178  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  26 
 
 		 794 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  26.84 
 
 		 812 aa  171  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  27.21 
 
 		 821 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  26.25 
 
 		 796 aa  161  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  25.56 
 
 		 811 aa  154  8e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  25.27 
 
 		 912 aa  149  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  24.52 
 
 		 795 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  24.94 
 
 		 929 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24 
 
 		 784 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  24.26 
 
 		 932 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  24.11 
 
 		 607 aa  125  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  24.61 
 
 		 1353 aa  124  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  22.7 
 
 		 941 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  24.29 
 
 		 910 aa  121  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  27.21 
 
 		 723 aa  121  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.43 
 
 		 794 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.92 
 
 		 782 aa  118  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  26.58 
 
 		 790 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  23.96 
 
 		 816 aa  115  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  27.59 
 
 		 1463 aa  114  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  28.36 
 
 		 982 aa  112  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  23.54 
 
 		 787 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.86 
 
 		 787 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  23.48 
 
 		 791 aa  110  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.4 
 
 		 783 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.4 
 
 		 783 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  104  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  104  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.26 
 
 		 783 aa  104  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  104  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 783 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  24.33 
 
 		 783 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  24.33 
 
 		 783 aa  103  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.18 
 
 		 786 aa  100  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  25.96 
 
 		 1070 aa  100  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  25.65 
 
 		 807 aa  99.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  22.48 
 
 		 794 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.08 
 
 		 792 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  23.66 
 
 		 788 aa  98.6  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  24.95 
 
 		 810 aa  98.2  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25.05 
 
 		 810 aa  97.8  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  22.71 
 
 		 820 aa  97.8  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.25 
 
 		 1087 aa  97.4  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  24.73 
 
 		 809 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  28.78 
 
 		 1485 aa  97.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  22.45 
 
 		 793 aa  97.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.95 
 
 		 808 aa  96.3  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  22.82 
 
 		 783 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 768 aa  96.3  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  22.82 
 
 		 783 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  22.82 
 
 		 783 aa  95.9  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  25.16 
 
 		 810 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  23.73 
 
 		 787 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  22.28 
 
 		 783 aa  95.5  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  27.17 
 
 		 1459 aa  95.1  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  22.36 
 
 		 657 aa  95.1  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 794 aa  95.1  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 794 aa  95.1  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  22.38 
 
 		 787 aa  95.1  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  23.09 
 
 		 786 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  24.57 
 
 		 809 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  25 
 
 		 795 aa  94.7  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  22.47 
 
 		 791 aa  94.7  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  23.19 
 
 		 788 aa  94.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.42 
 
 		 795 aa  94.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  24.95 
 
 		 809 aa  94.4  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  23.73 
 
 		 788 aa  94  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  22.93 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  24.88 
 
 		 990 aa  94  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 821 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  24.31 
 
 		 809 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  24.79 
 
 		 797 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.3 
 
 		 788 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  23.15 
 
 		 655 aa  92.8  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.59 
 
 		 818 aa  90.9  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  24.97 
 
 		 1058 aa  90.9  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  23.41 
 
 		 788 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  23.67 
 
 		 787 aa  90.5  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  24.49 
 
 		 793 aa  90.1  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  22.54 
 
 		 786 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>