208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1380 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  36.96 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  37.77 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  34.22 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  38.46 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  34.02 
 
 		 174 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  37.35 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  36.07 
 
 		 163 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  62.32 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  34.24 
 
 		 166 aa  94.4  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  58.9 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  35.59 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  54.76 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  58.9 
 
 		 169 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  63.64 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  61.76 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  34.33 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  63.64 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  48.98 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  62.32 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  31.98 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  56.94 
 
 		 173 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  58.33 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  34.57 
 
 		 168 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  31.09 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  49.48 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  30.56 
 
 		 163 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  30.96 
 
 		 163 aa  85.1  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  49.44 
 
 		 157 aa  84.7  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  57.35 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  33.91 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  35.43 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  53.33 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  56.06 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  33.75 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  52.11 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  31.61 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  53.85 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  36.79 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  40 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  43 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  46.25 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  38.78 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  56.92 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  39.8 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  32.11 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  38.84 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  57.81 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  46.67 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  43.18 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  38.95 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  57.89 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  54.39 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  54.39 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  54.39 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  54.39 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  57.69 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  38.95 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  38.95 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  42.5 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  50 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  28.4 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  55.17 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  62.26 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  35.29 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  46.15 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  45.45 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  46.15 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  46.15 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  29.1 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  44.29 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  53.45 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  53.45 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  53.33 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  52.54 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  51.72 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  43.21 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  53.45 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  36.8 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  42.42 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  32.98 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  30.33 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  43.08 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  30.33 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  42.42 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  30.33 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  30.33 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  53.19 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  43.08 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  29.51 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  34.29 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  32.73 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  43.08 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  43.75 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>