More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8633 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 488 aa  937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  63.09 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  68.71 
 
 		 482 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.38 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.03 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.89 
 
 		 788 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.64 
 
 		 519 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.35 
 
 		 499 aa  349  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.33 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.7 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.83 
 
 		 499 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.04 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.06 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.19 
 
 		 504 aa  296  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.37 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 		 498 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.57 
 
 		 487 aa  272  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 		 508 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.01 
 
 		 519 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.01 
 
 		 498 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  40.41 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 		 763 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 490 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.75 
 
 		 488 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.46 
 
 		 490 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00960  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.89 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 470 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 493 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.19 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.86 
 
 		 474 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  36.52 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 		 507 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.85 
 
 		 479 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.14 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  35.39 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.15 
 
 		 530 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.67 
 
 		 522 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 		 532 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 		 519 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.41 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.41 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.69 
 
 		 479 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 		 528 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 487 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.92 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  34.79 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  38.92 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.92 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  36.8 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 		 482 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  38.03 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 502 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  36.11 
 
 		 454 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 520 aa  192  9e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.29 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  35.46 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  38.83 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.31 
 
 		 529 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 494 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 		 489 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.95 
 
 		 534 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 733 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 485 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  36.14 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 548 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 		 1112 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.62 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.29 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  32.29 
 
 		 530 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>