More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6132 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 
657 aa  994    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  66.3 
 
 
671 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  63.47 
 
 
676 aa  855    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 
668 aa  925    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
656 aa  899    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 
699 aa  857    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 
682 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  65.81 
 
 
692 aa  848    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  62.1 
 
 
676 aa  839    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  64.28 
 
 
669 aa  877    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
677 aa  832    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  71.32 
 
 
684 aa  982    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 
691 aa  865    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  75.27 
 
 
659 aa  1026    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  67.09 
 
 
671 aa  858    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 
672 aa  860    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 
673 aa  865    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  78.6 
 
 
657 aa  1094    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 
666 aa  969    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
701 aa  942    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  65 
 
 
695 aa  870    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  67.83 
 
 
690 aa  900    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 
672 aa  828    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 
666 aa  877    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 
677 aa  862    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  67.14 
 
 
684 aa  866    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  67.52 
 
 
692 aa  892    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  64.93 
 
 
671 aa  855    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
670 aa  871    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 
658 aa  953    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  67.14 
 
 
684 aa  866    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 
660 aa  846    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 
669 aa  878    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  70.23 
 
 
685 aa  954    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  67.01 
 
 
668 aa  926    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
659 aa  1352    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  67.14 
 
 
684 aa  866    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 
691 aa  853    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
648 aa  597  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
659 aa  591  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
644 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
644 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
636 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
638 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
643 aa  571  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
646 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
645 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
583 aa  568  1e-160  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
645 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
643 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
604 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
639 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
636 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
644 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
662 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
636 aa  555  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
595 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
649 aa  554  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
636 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
639 aa  548  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
635 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
644 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
595 aa  548  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
581 aa  547  1e-154  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
635 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
644 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
635 aa  545  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
635 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 
635 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
645 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
635 aa  545  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 
635 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
647 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
635 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.13 
 
 
638 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
614 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
638 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
652 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
637 aa  535  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
648 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  45.66 
 
 
582 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
635 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
633 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
594 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
652 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
649 aa  538  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
641 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
635 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
635 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>