More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4372 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 392 aa  799    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  70.92 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.85 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  51.98 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.6 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.72 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  36.89 
 
 		 360 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  38.3 
 
 		 361 aa  209  9e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.67 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.83 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.83 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.55 
 
 		 371 aa  199  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.14 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.87 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  35.88 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  32.67 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.68 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33.24 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  33.24 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.97 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  32.29 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.25 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33.51 
 
 		 404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.96 
 
 		 422 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  36.6 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  32.11 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  32.85 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  32.49 
 
 		 439 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.69 
 
 		 391 aa  159  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.59 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  31.71 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  32.67 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  31.99 
 
 		 416 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.33 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  32.75 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  33.14 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  36.09 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  30.61 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  30.67 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  33.33 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  31.27 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  32.05 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  36.34 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  32.28 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  31.27 
 
 		 434 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  30.41 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  31.68 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.07 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  32.66 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  33.92 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  32.16 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  35.17 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35.63 
 
 		 423 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  31.2 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  31.48 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  36.8 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  29.94 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.52 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  29.39 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  29.39 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  34.42 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.14 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  29.25 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  32.08 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  34.5 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  33.13 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  31.29 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  31.47 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.31 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  29.91 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.13 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  29.62 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  30.14 
 
 		 351 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  31.6 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  30.58 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  31.94 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  28.97 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  34.36 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  29.33 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  30.15 
 
 		 368 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  32.46 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  31.58 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  29.05 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  32.19 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  34.42 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  36.98 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  34.11 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  31.44 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  31.64 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  31.34 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  36.14 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  34.72 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  28.03 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  31.25 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  35.46 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  30.84 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  34.37 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  33.43 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  32.61 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  36.81 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>