More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0860 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  42.64 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  43.24 
 
 		 410 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 735 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  38.93 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  39.9 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  35.41 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  36.61 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  29.32 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  29.69 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 394 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  32.59 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  32.88 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  30.42 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  29.53 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  29.53 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  34.25 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  29.53 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  29.53 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  29.53 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  29.5 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 408 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  27.13 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  30.65 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  30.87 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  30.87 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  30.87 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  30.87 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  28.75 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  30.99 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  31.43 
 
 		 407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 400 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  31.06 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  29.64 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.22 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.99 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>