More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3451 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 442 aa  890    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  67.19 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.19 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  66.96 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  58.73 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.42 
 
 		 455 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  56.9 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  57.89 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  43.97 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  41.35 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  42.68 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 421 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  34.4 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  35.33 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  40 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  36.93 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  31 
 
 		 455 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  36.46 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  35.54 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  36.46 
 
 		 458 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 458 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 459 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.05 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 454 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  35.97 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 458 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 435 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  30.77 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  35.25 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 446 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  30.82 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  32.99 
 
 		 458 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 450 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  36.59 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  33.88 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.97 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  37.13 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  35.41 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  36.76 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  34.36 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  36.26 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  38.75 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  28.48 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  32.18 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  37.64 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  36.26 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  35.9 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  38.75 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  32.11 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  37.87 
 
 		 456 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  32.68 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  38.69 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  35.56 
 
 		 446 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  35.79 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  36.9 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  36.9 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  36.9 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  36.16 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  36.16 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  36.16 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  36.16 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  36.16 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  35.42 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  35.42 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>