More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0086 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  54.36 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  33.46 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  29.62 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  30.36 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  27.34 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  28.33 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  28.21 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  29.89 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  28.93 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  29.47 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  30.25 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  27.49 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  27.55 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  27.21 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  24.22 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  25.68 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  25.61 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  27.53 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  25.45 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  25.28 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  25.78 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  26.22 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  25.69 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  24.91 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  24.91 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  24.91 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  24.91 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  24.62 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  24.56 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  24.56 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  24.56 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  24.56 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  25.26 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.83 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  43.96 
 
 		 1755 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  35.24 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  37.86 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.04 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.04 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  25.7 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 704 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  32.62 
 
 		 658 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 		 1264 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.5 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  23.45 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  45.71 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  45.21 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  23.57 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.65 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  46.58 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  37.1 
 
 		 2000 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.42 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  36.27 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.19 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  24.86 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34.96 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.89 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.21 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  36.54 
 
 		 890 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  36.89 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.01 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  39.22 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  43.21 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  23.86 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  43.21 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>