186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6093 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  65.94 
 
 
504 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  100 
 
 
505 aa  1040    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  67.61 
 
 
478 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  59.06 
 
 
508 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  52.6 
 
 
504 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  51.91 
 
 
499 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  38.09 
 
 
515 aa  335  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  37.38 
 
 
518 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  34.57 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  34.48 
 
 
486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  32.07 
 
 
750 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  33.69 
 
 
524 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.61 
 
 
564 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  31.62 
 
 
521 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  33.2 
 
 
542 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  31.43 
 
 
525 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  33.4 
 
 
555 aa  223  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  32.86 
 
 
507 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  33.62 
 
 
521 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  30.17 
 
 
506 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  31.94 
 
 
508 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  31.94 
 
 
508 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  31.94 
 
 
533 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  30.57 
 
 
499 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  31.55 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  28 
 
 
495 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  30.87 
 
 
511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  30.87 
 
 
511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  30.87 
 
 
511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  33.2 
 
 
495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  30.74 
 
 
508 aa  200  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  31.12 
 
 
527 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  31 
 
 
485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  32.04 
 
 
541 aa  197  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  29.74 
 
 
515 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  31.76 
 
 
516 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  27.99 
 
 
522 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  29.55 
 
 
542 aa  196  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  29.28 
 
 
515 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  29.75 
 
 
546 aa  193  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  31.53 
 
 
525 aa  193  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  31.25 
 
 
522 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  31.74 
 
 
521 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  28.92 
 
 
518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  28.62 
 
 
643 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  30.19 
 
 
523 aa  190  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  30.42 
 
 
520 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
505 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  29.3 
 
 
475 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  29.17 
 
 
493 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  29.45 
 
 
520 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  29.4 
 
 
518 aa  187  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  31.01 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  29.51 
 
 
538 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  29.55 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  30.36 
 
 
540 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  30.06 
 
 
459 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  28.63 
 
 
545 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  27.66 
 
 
551 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  30.23 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  28.43 
 
 
530 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  27.35 
 
 
544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  27.62 
 
 
551 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  26.68 
 
 
506 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  26.88 
 
 
532 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  28.08 
 
 
537 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  25.49 
 
 
505 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  28.6 
 
 
535 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  25.36 
 
 
542 aa  150  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30.26 
 
 
532 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  28.87 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  26.53 
 
 
539 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.97 
 
 
505 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  28.24 
 
 
504 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  26.23 
 
 
571 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  35.04 
 
 
557 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  25.27 
 
 
547 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.27 
 
 
494 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  25.62 
 
 
527 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  25.6 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.84 
 
 
522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  26.01 
 
 
521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  29.32 
 
 
300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  32.74 
 
 
520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  38.1 
 
 
597 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  27.6 
 
 
484 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  26.13 
 
 
559 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  31.13 
 
 
597 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  23.51 
 
 
613 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  26.44 
 
 
566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  28.43 
 
 
519 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  25.67 
 
 
536 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.4 
 
 
517 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  30.2 
 
 
533 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  27.53 
 
 
542 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  30.48 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
539 aa  98.2  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  29.43 
 
 
540 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>