More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5573 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 474 aa  895    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  69.06 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  46.57 
 
 		 492 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.81 
 
 		 498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.41 
 
 		 763 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.25 
 
 		 507 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.44 
 
 		 490 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.28 
 
 		 487 aa  282  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.38 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.53 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 		 527 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 519 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 487 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  42.01 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 491 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.34 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.09 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.89 
 
 		 487 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.45 
 
 		 489 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  35.73 
 
 		 498 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.38 
 
 		 479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.34 
 
 		 497 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.15 
 
 		 479 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.15 
 
 		 479 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.05 
 
 		 1112 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.55 
 
 		 487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.09 
 
 		 514 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.06 
 
 		 482 aa  242  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.94 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.07 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2088  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 513 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  38.4 
 
 		 481 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.63 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.44 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.44 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.38 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  41.83 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.83 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 788 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 		 480 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 		 480 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 		 480 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 		 480 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 470 aa  236  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.84 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.04 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 		 548 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 519 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 		 482 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.84 
 
 		 509 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.13 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 494 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  37.31 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.7 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 		 502 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.13 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  41.13 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  40.92 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.32 
 
 		 494 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.01 
 
 		 496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 481 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  35.34 
 
 		 470 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.92 
 
 		 478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.92 
 
 		 478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.92 
 
 		 478 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.92 
 
 		 478 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 483 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 		 522 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.46 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 506 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.7 
 
 		 499 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  37.01 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 504 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.04 
 
 		 504 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.04 
 
 		 467 aa  216  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 		 489 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  38.97 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  34.44 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  38.19 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2752  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.61 
 
 		 503 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4259  putative transmembrane efflux protein  41.15 
 
 		 445 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.796571  normal  0.885395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>