More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3040 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  56.68 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.67 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  51.36 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.34 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  50.45 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  52.23 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  49.78 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.35 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.78 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.2 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.66 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  50.67 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.33 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.22 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.67 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.61 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.58 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.64 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.98 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  45.91 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  45.91 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.88 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.11 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  47.53 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.88 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.47 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  45.29 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  50 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.18 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.56 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.64 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.32 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  45 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.85 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.42 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.68 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  47.51 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 218 aa  178  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 219 aa  178  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.33 
 
 		 241 aa  177  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.75 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.4 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  49.32 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.67 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  47 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  46.82 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  44.24 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  45.91 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.77 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  45.78 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  47.49 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>