53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1682 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  74.23 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  57.25 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  58.77 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  51.31 
 
 		 275 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  51.31 
 
 		 275 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  51.31 
 
 		 275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  51.31 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  50.73 
 
 		 275 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  50.87 
 
 		 553 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  50.87 
 
 		 539 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  47.84 
 
 		 542 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  46.98 
 
 		 558 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  46.55 
 
 		 558 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  45.69 
 
 		 1310 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  45.81 
 
 		 1346 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  44.8 
 
 		 1503 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  37.02 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  34.94 
 
 		 538 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  32.75 
 
 		 466 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  31.27 
 
 		 657 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  33.59 
 
 		 539 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  31.37 
 
 		 596 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  33.19 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  34.16 
 
 		 442 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  31.13 
 
 		 617 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  31.82 
 
 		 365 aa  98.2  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  29.89 
 
 		 614 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  34.74 
 
 		 516 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  30.92 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  28.91 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  36.81 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  29.49 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  29.88 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  28.24 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  32.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  34.88 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  31.25 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  34.11 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  30 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  30.3 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  34.38 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  29.55 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  27.61 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  27.61 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4024  deoxyribonuclease I  27.69 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000163525  decreased coverage  0.000370071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  29.46 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  26.15 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  28.24 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02310  Deoxyribonuclease I  27.39 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  26.15 
 
 		 251 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0171  ribonuclease domain-containing protein  57.14 
 
 		 68 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  27.48 
 
 		 231 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>