More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1481 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  100 
 
 		 93 aa  183  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  73.91 
 
 		 94 aa  136  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  43.96 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  41.57 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0115  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  30 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  32.97 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1678  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000685553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>