35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0115 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0115  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
139 aa  276  7e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  38.46 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  32.97 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  30.11 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  32.26 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1678  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000685553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  27.13 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  28.57 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2627  ribosomal protein S6  31.82 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  25.86 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  38.78 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  26.26 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  25.27 
 
 
94 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2377  ribosomal protein S6  26.97 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.21684e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 
152 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  44.44 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  25.81 
 
 
176 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  40.82 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  29.46 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  29.67 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 
124 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>