138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2627 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2627  ribosomal protein S6  100 
 
 		 140 aa  296  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  27.88 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  26.09 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  27.88 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  26.92 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  27.71 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  26.37 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  25.97 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  25.56 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  23.91 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  29.23 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  28.24 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  28.09 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  24.74 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  23.91 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  31.43 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 94 aa  43.9  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  25.56 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  22.83 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  22.73 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  22.22 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  26.14 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  25 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  22.56 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3402  ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301569  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1526  ribosomal protein S6  37.29 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.506351  normal  0.0309301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0115  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 		 147 aa  42  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  27.06 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  29.55 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  26.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  27.66 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  28.28 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  25.95 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  28.41 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.77 
 
 		 127 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  24.44 
 
 		 138 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2389  ribosomal protein S6  29.81 
 
 		 137 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  25 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 		 117 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  26.44 
 
 		 101 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  25.84 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  26.44 
 
 		 101 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  29.41 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  27.59 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  25 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  27.84 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>