265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0659 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  45.46 
 
 		 1002 aa  820    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  51.59 
 
 		 990 aa  975    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  46.44 
 
 		 983 aa  847    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  49.74 
 
 		 997 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  46.04 
 
 		 999 aa  823    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  45.87 
 
 		 1023 aa  815    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  44.42 
 
 		 1031 aa  803    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  44.8 
 
 		 1016 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  40.43 
 
 		 1000 aa  645    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  43.86 
 
 		 991 aa  762    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  40.89 
 
 		 1011 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  49.03 
 
 		 976 aa  702    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 969 aa  1982    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  41.65 
 
 		 971 aa  729    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  40 
 
 		 1023 aa  628  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  38.54 
 
 		 989 aa  628  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  40.04 
 
 		 1034 aa  628  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  39.82 
 
 		 1022 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  41.48 
 
 		 1009 aa  598  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  36.44 
 
 		 984 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  36.29 
 
 		 992 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  35.2 
 
 		 1004 aa  583  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  37.32 
 
 		 965 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  37.02 
 
 		 1009 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  36.57 
 
 		 1012 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  36.87 
 
 		 1008 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  39.6 
 
 		 1010 aa  569  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  37.98 
 
 		 985 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  35.57 
 
 		 1029 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1007 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1022 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  34.63 
 
 		 1027 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  37.2 
 
 		 1035 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  33.4 
 
 		 1052 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  35.71 
 
 		 1067 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1039 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  37.56 
 
 		 905 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  34.85 
 
 		 1112 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1059 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1069 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  33.01 
 
 		 1006 aa  491  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  32.75 
 
 		 1051 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  34.77 
 
 		 1060 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  34.6 
 
 		 1067 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1063 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1081 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1041 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  34.67 
 
 		 1102 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  32.97 
 
 		 1039 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  33.63 
 
 		 1087 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  31.53 
 
 		 1073 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  31.94 
 
 		 1078 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1033 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  32.53 
 
 		 1085 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  31.66 
 
 		 1079 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  30.52 
 
 		 1142 aa  358  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  27.95 
 
 		 1035 aa  269  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04460  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.57 
 
 		 1010 aa  152  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.58 
 
 		 1084 aa  146  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.2 
 
 		 1003 aa  145  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.07 
 
 		 1003 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0608  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.34 
 
 		 1006 aa  140  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.84 
 
 		 1053 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.48 
 
 		 1074 aa  140  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.33 
 
 		 1044 aa  138  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  27.1 
 
 		 1023 aa  137  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.71 
 
 		 1070 aa  137  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  26.08 
 
 		 1051 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  26.29 
 
 		 1289 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.07 
 
 		 1041 aa  134  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2793  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.2 
 
 		 1012 aa  134  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.01 
 
 		 1067 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  26.46 
 
 		 1059 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.24 
 
 		 1031 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  27.46 
 
 		 1030 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.08 
 
 		 1042 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3082  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.43 
 
 		 1085 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.67 
 
 		 1035 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.97 
 
 		 1032 aa  128  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.85 
 
 		 1032 aa  127  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.26 
 
 		 1079 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7554  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.76 
 
 		 1072 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.32 
 
 		 967 aa  126  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3424  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.87 
 
 		 984 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.8 
 
 		 1084 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.04 
 
 		 1060 aa  126  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.32 
 
 		 967 aa  126  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  24.71 
 
 		 984 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1124  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.58 
 
 		 1084 aa  125  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.55 
 
 		 1029 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.93 
 
 		 1068 aa  124  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3386  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.02 
 
 		 1052 aa  124  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2012  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.12 
 
 		 1046 aa  124  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.599838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.41 
 
 		 855 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  23.83 
 
 		 1044 aa  121  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.8 
 
 		 986 aa  121  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  23.05 
 
 		 1033 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2909  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.5 
 
 		 1042 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2450  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR family  24.26 
 
 		 1042 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.68 
 
 		 1028 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>