More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4125 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  72.91 
 
 		 205 aa  300  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  71.92 
 
 		 203 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.46 
 
 		 205 aa  292  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.46 
 
 		 205 aa  288  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  67.49 
 
 		 203 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.97 
 
 		 205 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  67.49 
 
 		 203 aa  284  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  68.97 
 
 		 203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  70.44 
 
 		 208 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  67.49 
 
 		 203 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.5 
 
 		 227 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  67.98 
 
 		 203 aa  276  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  67 
 
 		 208 aa  275  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.49 
 
 		 208 aa  275  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.52 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  66.5 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  64.71 
 
 		 206 aa  260  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.58 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.19 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.7 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  60.2 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.62 
 
 		 214 aa  241  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.62 
 
 		 214 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.71 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  60.2 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  59.61 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.62 
 
 		 214 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  58.62 
 
 		 214 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.13 
 
 		 214 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  57.07 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.64 
 
 		 221 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  57 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  57 
 
 		 300 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  57 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  56.5 
 
 		 266 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  56.5 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  56.5 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  53.66 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  56.16 
 
 		 217 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  55.72 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  50.74 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  51.72 
 
 		 213 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  47.74 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  52.33 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  54.04 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  49.22 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  46.63 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.25 
 
 		 205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.2 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  47.67 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  45.18 
 
 		 197 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  46.32 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.6 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  44.79 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  41.54 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  41.79 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.19 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  41.29 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  37.13 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.11 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  35.85 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  37.13 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  30.95 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  33.66 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  34.63 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.95 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  33.67 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  34.95 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  33.66 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  35.82 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  35.29 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  35.32 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  33.49 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  37.13 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  31.22 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.05 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  35.15 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  32.35 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 200 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  32.84 
 
 		 200 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  33.84 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  33.18 
 
 		 256 aa  99  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  34.15 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  30.5 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  34 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  34.9 
 
 		 209 aa  97.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  34.83 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  31.94 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  31.73 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  32.32 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>