More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3787 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  68.42 
 
 		 324 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  66.78 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  66.88 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  63.35 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  64.87 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  67.33 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  64.24 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  63.49 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  63.7 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  61.72 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  61.24 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  59.93 
 
 		 301 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  60.4 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  58.69 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  60.13 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  56.51 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  56.25 
 
 		 332 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  56.51 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  53.09 
 
 		 337 aa  325  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  53.92 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  54.3 
 
 		 291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  52.87 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  53.23 
 
 		 299 aa  301  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  52.82 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  52.82 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  54.15 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  52.16 
 
 		 290 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  47.87 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  57 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  51.83 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  53.97 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  53.97 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  51.14 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50.16 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  51.32 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  51.66 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  52.51 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  47.78 
 
 		 421 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  47.78 
 
 		 377 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  45.54 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  47.45 
 
 		 384 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  46.03 
 
 		 358 aa  279  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  49.17 
 
 		 330 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  44.82 
 
 		 408 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  46.73 
 
 		 390 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  45.57 
 
 		 409 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  52.17 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  46.93 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  45.67 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  47.95 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.69 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  46.03 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  46.47 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  45.87 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.23 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  43.75 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.43 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  43.51 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  39.74 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  40.58 
 
 		 303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  42.9 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  42.12 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  40.71 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  40.71 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.14 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  40.19 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  40.19 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  40.71 
 
 		 352 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  40.19 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  40.71 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  40.07 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  38.49 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  38.03 
 
 		 259 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  32.93 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.97 
 
 		 614 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  34.68 
 
 		 259 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.22 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.01 
 
 		 433 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.43 
 
 		 751 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.1 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.15 
 
 		 742 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  29.05 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  28.53 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 621 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.64 
 
 		 554 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 861 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.13 
 
 		 829 aa  99.4  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  30.87 
 
 		 319 aa  99  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  32.19 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  30.09 
 
 		 628 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.13 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.45 
 
 		 586 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.44 
 
 		 517 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.81 
 
 		 517 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 1818 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.61 
 
 		 826 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  37.12 
 
 		 437 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>