More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3191 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 470 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  69.76 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  71.12 
 
 		 460 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  64.72 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  55.15 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  54.94 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.76 
 
 		 453 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  57.34 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  48.11 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  48.52 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  49.43 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  48.97 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  48.39 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  47.6 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  47.26 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  46.8 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  48.91 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  45.01 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  46.1 
 
 		 448 aa  315  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.21 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.61 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  49.35 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.15 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  46.82 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  45.37 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  44.32 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  42.13 
 
 		 419 aa  259  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.17 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.47 
 
 		 433 aa  252  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  41.06 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.5 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.74 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  40.22 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  38.16 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  42.05 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.94 
 
 		 535 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.19 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  34.14 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  37.5 
 
 		 424 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.04 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.48 
 
 		 422 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  31.42 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.99 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  30.34 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  34.63 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.97 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.37 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.37 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.94 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.04 
 
 		 444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  30.86 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  32.07 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.42 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  32.49 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  30.53 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  32.74 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  30.82 
 
 		 429 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  32.92 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  32.9 
 
 		 429 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  32.4 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  33.26 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  32.64 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  32.64 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  32.64 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  31.77 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  32.64 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  32.64 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  31.77 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.18 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.63 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  28.69 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.1 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  32.64 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  32.03 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.95 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  32.38 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  32.11 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.27 
 
 		 428 aa  173  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  29.44 
 
 		 427 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.14 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  30.19 
 
 		 451 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  29.22 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  30.19 
 
 		 451 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  29.26 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.17 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  30.91 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  29.67 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  29.71 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  29.67 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  33.16 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  32.89 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  28.99 
 
 		 429 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  34.75 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  30.66 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.03 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.45 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  28.76 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  27.07 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  34.75 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  31.53 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>