241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1172 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 395 aa  764    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  31 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  34.9 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 780 aa  150  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  31.38 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  26.49 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  28.69 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  27.15 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  29.28 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  30.15 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  26.18 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  28.62 
 
 		 372 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  28.99 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  26.87 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  31.74 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  28.06 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  28.61 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  24.26 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  26.35 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  27.65 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  28.64 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  25.57 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  23.94 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  20.77 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  25.07 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  26.95 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  25.14 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  29.47 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.35 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  30.53 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  29.95 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  25.13 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  21.82 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  29.2 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  21.57 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  24.44 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.56 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  31.53 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.16 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.27 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.03 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  21.85 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  28.1 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  21.31 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  22.57 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  22.62 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  19.66 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25.95 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.39 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  19.37 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.66 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.38 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  20.91 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  20.6 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  20.71 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  23.92 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  18.78 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>