More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5767 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  79.72 
 
 		 437 aa  708    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 439 aa  866    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  59.22 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  60.96 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  57.79 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  58.24 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  56 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  55.2 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  53.15 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  54.75 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  52.48 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  52.7 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  51.25 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  51.02 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  52.36 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  51.47 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  51.02 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.31 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.31 
 
 		 447 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.07 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  46.06 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.84 
 
 		 447 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.7 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  44.71 
 
 		 421 aa  345  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  46.14 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.06 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.25 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.92 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.92 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  45 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.67 
 
 		 435 aa  339  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.77 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  44.57 
 
 		 448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.65 
 
 		 443 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.19 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.47 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  44.65 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.17 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  39.48 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  46.06 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  44.06 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  44.81 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.44 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  40.14 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  44.47 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.25 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  41.44 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.58 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.03 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.67 
 
 		 448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  42.01 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 447 aa  319  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 447 aa  319  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  44.47 
 
 		 443 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  41 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  40.04 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  42.2 
 
 		 447 aa  316  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.29 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  41.61 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.24 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.56 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  42.95 
 
 		 443 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.63 
 
 		 446 aa  312  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.82 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  43.93 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  43.19 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  42.31 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  42.79 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  39.39 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  40.27 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  42.79 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  40.85 
 
 		 437 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  42.25 
 
 		 436 aa  309  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.34 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  42.32 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  42.22 
 
 		 427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  40.36 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  39.78 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.39 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  41.12 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>