75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3429 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 123 aa  256  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  74.59 
 
 		 124 aa  196  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  61.34 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  42.11 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  41.23 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  42.59 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  37.72 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  35 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  36.52 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  34.48 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  34.21 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  30.51 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  29.57 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  29.57 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.43 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  28.45 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  29.2 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  27.2 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  27.2 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  29.41 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  26.09 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  27.2 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  27.2 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  27.2 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  25.22 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  27.87 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  25.22 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  28.07 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  27.05 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  27.87 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  24.53 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  26.97 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  25.23 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  36 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  25.22 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  25.62 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  25.66 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  31.76 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  24.39 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  22.4 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  24.79 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  22.4 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  29.29 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  29.29 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  29.37 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  27.68 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  23.28 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  23.64 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  28.75 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  23.28 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  23.28 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 117 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  22.41 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  21.74 
 
 		 122 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>