More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0013 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
366 aa  752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.88 
 
 
365 aa  337  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  44.48 
 
 
368 aa  294  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.7 
 
 
355 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.58 
 
 
356 aa  240  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.22 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.09 
 
 
369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.81 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.09 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.09 
 
 
369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.09 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.68 
 
 
350 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.68 
 
 
350 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.68 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.09 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.81 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.68 
 
 
350 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.39 
 
 
350 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  37.86 
 
 
350 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.36 
 
 
369 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.36 
 
 
369 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  35.81 
 
 
369 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.96 
 
 
346 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.81 
 
 
353 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.39 
 
 
350 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.1 
 
 
350 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  36.81 
 
 
353 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.39 
 
 
364 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.71 
 
 
347 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  35.03 
 
 
367 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  36.07 
 
 
356 aa  204  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  33.9 
 
 
367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.15 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.65 
 
 
360 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  34.82 
 
 
376 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.82 
 
 
345 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.82 
 
 
345 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.22 
 
 
371 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.57 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.23 
 
 
343 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.99 
 
 
356 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.46 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.05 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.52 
 
 
355 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5487  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
372 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111107  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.87 
 
 
368 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.7 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.71 
 
 
395 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.49 
 
 
369 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.22 
 
 
369 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  30.89 
 
 
370 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  30.11 
 
 
374 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0975  muconate cycloisomerase  29.17 
 
 
395 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.995567  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.97 
 
 
390 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.14 
 
 
396 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.99 
 
 
341 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1689  muconate cycloisomerase  30.03 
 
 
374 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1834  chloromuconate cycloisomerase, putative  33.05 
 
 
356 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4400  muconate cycloisomerase  30.03 
 
 
372 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3512  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.61 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.05 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1406  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.77 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.61 
 
 
382 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  29.32 
 
 
377 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2373  hypothetical protein  32.39 
 
 
344 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.926333 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.18 
 
 
382 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 
345 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.09 
 
 
367 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2730  muconate cycloisomerase I  28.93 
 
 
373 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4056  L-alanine-DL-glutamate epimerase fmaily protein  30.89 
 
 
371 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4406  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.49 
 
 
350 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.804471  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4344  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.49 
 
 
350 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.35 
 
 
378 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.81 
 
 
375 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.88 
 
 
378 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  27.35 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.45 
 
 
373 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.4 
 
 
375 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.89 
 
 
367 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.77 
 
 
393 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4029  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.84 
 
 
385 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1800  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.53 
 
 
368 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.45 
 
 
373 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.87 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.92 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.4 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.31 
 
 
346 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.27 
 
 
367 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.27 
 
 
367 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  27.58 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  27.17 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.37 
 
 
370 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0986  muconate cycloisomerase  28.92 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2566  muconate cycloisomerase  28.92 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2119  muconate and chloromuconate cycloisomerases  29.46 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  0.138731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.82 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.03 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1375  muconate cycloisomerase  28.65 
 
 
377 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0200  muconate cycloisomerase  28.65 
 
 
377 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1572  muconate cycloisomerase  28.65 
 
 
377 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>