164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  100 
 
 
541 aa  1084    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  52.64 
 
 
518 aa  537  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  52.87 
 
 
523 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  50.19 
 
 
508 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  46.71 
 
 
521 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  45 
 
 
524 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  45.44 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  46 
 
 
506 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  46.04 
 
 
542 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  43.04 
 
 
500 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  43.96 
 
 
521 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  45.73 
 
 
527 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  41.58 
 
 
525 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  41.18 
 
 
537 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  42.03 
 
 
507 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  43.86 
 
 
485 aa  329  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  42.28 
 
 
515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  37.12 
 
 
545 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  42.15 
 
 
495 aa  321  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  38.52 
 
 
522 aa  312  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  39.71 
 
 
495 aa  299  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  37.17 
 
 
511 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  37.17 
 
 
511 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  37.17 
 
 
511 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  37.65 
 
 
546 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  39.96 
 
 
542 aa  286  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  38.7 
 
 
516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  38.17 
 
 
520 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.94 
 
 
520 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  36.25 
 
 
533 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  36.25 
 
 
508 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  36.25 
 
 
508 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
505 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  38.31 
 
 
538 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  39 
 
 
521 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  36.84 
 
 
525 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  37.04 
 
 
540 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  39.09 
 
 
518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.68 
 
 
522 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  36.74 
 
 
505 aa  263  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  33.52 
 
 
564 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.86 
 
 
535 aa  223  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  33.12 
 
 
544 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.8 
 
 
551 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  33.81 
 
 
557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  32.33 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  33.26 
 
 
555 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  30.87 
 
 
535 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  32.35 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  32.55 
 
 
499 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  33.68 
 
 
571 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  33.33 
 
 
551 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  31.13 
 
 
504 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  29.65 
 
 
542 aa  190  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  33.13 
 
 
546 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  29.12 
 
 
530 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  32.04 
 
 
505 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  30.43 
 
 
506 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.78 
 
 
486 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.32 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  29.44 
 
 
521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  29.4 
 
 
499 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.02 
 
 
547 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.68 
 
 
478 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  28.69 
 
 
505 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.49 
 
 
508 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  28.31 
 
 
532 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  29.28 
 
 
613 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  28.57 
 
 
527 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  30.35 
 
 
566 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  27.96 
 
 
504 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  29.96 
 
 
484 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  29.74 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  27.66 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  37.93 
 
 
643 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  27.75 
 
 
459 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  36.48 
 
 
300 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  35.12 
 
 
504 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  24.81 
 
 
597 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  30.64 
 
 
493 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  27.37 
 
 
494 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  27.31 
 
 
532 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  29.59 
 
 
559 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  27.95 
 
 
520 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  27.7 
 
 
536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  36.16 
 
 
597 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  27.5 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.48 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  34.68 
 
 
556 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  26.8 
 
 
517 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  29.36 
 
 
557 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  28.09 
 
 
750 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  34.21 
 
 
480 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  34.47 
 
 
522 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  25.44 
 
 
678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2329  hypothetical protein  36.89 
 
 
331 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246702  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  26.87 
 
 
514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  37.16 
 
 
623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
486 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
525 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>