90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2329 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2329  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246702  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4114  hypothetical protein  76.74 
 
 		 185 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.797594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  37.13 
 
 		 506 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  35.56 
 
 		 541 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  36.51 
 
 		 525 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  37.56 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  37.44 
 
 		 508 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  35.06 
 
 		 518 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  34.92 
 
 		 542 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  34.01 
 
 		 540 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  35.22 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  37.62 
 
 		 527 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  36.05 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  35.35 
 
 		 542 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  33.95 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  37.12 
 
 		 515 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  34.65 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  31.3 
 
 		 523 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  29.93 
 
 		 518 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  35.45 
 
 		 522 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  33.47 
 
 		 524 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.26 
 
 		 551 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  33.91 
 
 		 515 aa  97.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  36.24 
 
 		 495 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  40.14 
 
 		 544 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  33.21 
 
 		 545 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  32.65 
 
 		 533 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  32.65 
 
 		 508 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  32.65 
 
 		 508 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  35.34 
 
 		 476 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  31.4 
 
 		 535 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.8 
 
 		 564 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  30.7 
 
 		 546 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  31.73 
 
 		 511 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  31.73 
 
 		 511 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  31.73 
 
 		 511 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  33.89 
 
 		 521 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  30.24 
 
 		 542 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  34.47 
 
 		 521 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  32.38 
 
 		 516 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  31.73 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  31.28 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  34.56 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  33.77 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  30.61 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  34.17 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  36.36 
 
 		 643 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  41.44 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  30.2 
 
 		 571 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  39.1 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.13 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  31.93 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  34.31 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  34.19 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.71 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  26.8 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  35 
 
 		 518 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  39.51 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  36.79 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  30.49 
 
 		 486 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  30.1 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  37.89 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  34.09 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  25.49 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  34.93 
 
 		 556 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  29.93 
 
 		 504 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  27.14 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  35.04 
 
 		 557 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3355  TAP domain protein  39.56 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.1 
 
 		 478 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  34.09 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 493 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  27.4 
 
 		 546 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  40.24 
 
 		 515 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  28.39 
 
 		 484 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  30.67 
 
 		 623 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  30.56 
 
 		 536 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.32 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  29.85 
 
 		 613 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  23.12 
 
 		 535 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  28.78 
 
 		 504 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  33.58 
 
 		 559 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  29.41 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01144  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0472782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  28.21 
 
 		 547 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  26.61 
 
 		 557 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  24.47 
 
 		 532 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  25.41 
 
 		 490 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>