71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3355 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3355  TAP domain protein  100 
 
 
321 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  40.48 
 
 
486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  35.86 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  35.21 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  38.81 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  32.03 
 
 
504 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  37.3 
 
 
495 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  43.96 
 
 
499 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  32.98 
 
 
476 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  31.78 
 
 
541 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  25.93 
 
 
505 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  31.78 
 
 
523 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  36.09 
 
 
540 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  31.01 
 
 
518 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.03 
 
 
504 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  42.05 
 
 
459 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  25.54 
 
 
478 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 
555 aa  59.3  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  26.52 
 
 
490 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  37.78 
 
 
485 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  34.62 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  28.5 
 
 
571 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  35.42 
 
 
507 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  40.28 
 
 
514 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  34.44 
 
 
525 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  35.56 
 
 
514 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2329  hypothetical protein  39.56 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246702  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  31.13 
 
 
508 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  34.4 
 
 
506 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  38.75 
 
 
518 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.18 
 
 
750 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  32.58 
 
 
521 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  31.06 
 
 
515 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  32.61 
 
 
542 aa  52.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  31.06 
 
 
493 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  34.91 
 
 
524 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  33.33 
 
 
527 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  30.53 
 
 
522 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  30.1 
 
 
597 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  29.17 
 
 
500 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  34.74 
 
 
521 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  32.59 
 
 
551 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.46 
 
 
544 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  34.94 
 
 
516 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  33.73 
 
 
511 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  33.73 
 
 
511 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  32.08 
 
 
546 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  33.73 
 
 
511 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  34.67 
 
 
643 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  37.5 
 
 
537 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  35.71 
 
 
551 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  31.58 
 
 
495 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  34.07 
 
 
508 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  27.37 
 
 
524 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  32.99 
 
 
533 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  33.33 
 
 
521 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  29.7 
 
 
475 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  34.07 
 
 
508 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  27.42 
 
 
564 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  41.67 
 
 
522 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  34.15 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 
505 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.09 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  34.21 
 
 
566 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  28.87 
 
 
545 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  32.88 
 
 
542 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  32.05 
 
 
678 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  32.97 
 
 
520 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  31.15 
 
 
515 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  38.37 
 
 
535 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  31.43 
 
 
557 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>