57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4113 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  440  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  97.64 
 
 
212 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  93.87 
 
 
212 aa  413  1e-115  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  82.08 
 
 
212 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  82.08 
 
 
212 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.31362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  81.6 
 
 
212 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  81.6 
 
 
212 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  4.96851e-12 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  82.55 
 
 
212 aa  358  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  66.67 
 
 
220 aa  297  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  59.43 
 
 
222 aa  269  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  59.43 
 
 
220 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  56.6 
 
 
232 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  60.09 
 
 
222 aa  259  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  58.02 
 
 
226 aa  251  4e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.69669e-05  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  52.56 
 
 
223 aa  211  5e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  37.67 
 
 
222 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
212 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  39.34 
 
 
225 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  34.12 
 
 
212 aa  146  2e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  37.21 
 
 
214 aa  147  2e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  33.81 
 
 
212 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  35.38 
 
 
215 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  34.43 
 
 
233 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  32.85 
 
 
257 aa  130  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  35.55 
 
 
217 aa  127  1e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  36.32 
 
 
222 aa  127  1e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  34.27 
 
 
213 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
230 aa  124  8e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  35.55 
 
 
223 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
212 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
216 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  32.06 
 
 
215 aa  120  2e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
212 aa  117  1e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  33.02 
 
 
212 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  32.55 
 
 
212 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  31.6 
 
 
223 aa  114  8e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  32.09 
 
 
211 aa  113  2e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  32.55 
 
 
217 aa  112  4e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  30.19 
 
 
212 aa  111  8e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  29.72 
 
 
215 aa  110  1e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
214 aa  108  4e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  29.05 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.03 
 
 
214 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
211 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  30.37 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  30.05 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  23.56 
 
 
214 aa  73.9  2e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  27.51 
 
 
214 aa  70.9  1e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  23.28 
 
 
274 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 
746 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.96 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  25.54 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  39.06 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
271 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.73 
 
 
273 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>